Os Centros de Excelência do CETAO foram criados com o intuíto de se aprofundar o conhecimento em determinadas áreas especificas, pouco exploradas através de parcerias com entidades que são referências em suas áreas.
    

     O foco principal é agrupar pesquisadores interessados no desenvolvimento, pesquisa e capacitação clínica. Os beneficiários são a população que pode ter um atendimento diferenciado e específico nestes centros.